Las diferencias entre gobierno y el sector educativo, en especial el área docente, ha derivado que los estamentos académicos de la universidad pública en todo el país, se declarará en Asamblea Permanente, para debatir las propuestas que deberán ser presentadas ante el gobierno nacional y así poder solucionar las deficiencias de la Universidad estatal, la cual se ha visto reducida durante los últimos años.
La reforma tributaria del 2016, generó a los profesores y docentes una serie de gravámenes, que perjudican sus ingresos, con impuestos que nada tienen que ver con sus actividades académicas y profesionales, generando que incluso varios docentes tengan que pagar hasta mil veces más, por años tributarios que anteriormente significaban un gasto menor.
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Asegura además que la universidad del Tolima, al igual que el resto de universidades que se sumaron a estas Asambleas Permanentes, desde hace dos años, fue la falta de aumento en los recursos que deben ser girados por el gobierno nacional desde el año de 1992, donde se ha mantenido el mismo monto de dinero del estado.
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Los representantes de los estudiantes del alma mater, afirman que en el caso particular de la UT además de mostrar su inconformismo, con el gobierno nacional, también están mostrando su voz de protesta por lo que se ha venido presentando en cuanto a la pérdida de autonomía en el campus y el desconocimiento del verdadero déficit económico de la institución.
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Según se expresó, a la fecha el rector Omar Mejía Patiño ha mostrado balances donde se evidencia la recuperación económica de la Universidad en su período de gestión pasando de 24 mil millones de pesos a 8 mil millones de Pesos, mas no se tiene una evidencia por parte de la comunidad académica si este estado de mejora es cierto o no.
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Cabe recordar que la Universidad del Tolima, tiene una demanda vigente ante el Consejo de estado para recuperar cerca de 20 mil millones de pesos que le son adeudados por la Gobernación del Tolima por concepto de transferencias al centro universitario.